Protein pengangkut anion jalur 3

Cari
Struktur	Swiss-model
Domain	InterPro

keluarga pembawa zat terlarut 4 (penukar anion), ahli 1, protein adaptor
keluarga pembawa zat terlarut 4 (penukar anion), ahli 1, protein adaptor
Pengenal pasti
Simbol	SLC4A1AP
Gen NCBI	22950
HGNC	13813
OMIM	602655
RefSeq	NM_018158
UniProt	P02730
Other data
Lokus	Kromosom 2 p23.3
Struktur
Cari
Struktur	Swiss-model
Domain	InterPro

SLC4A1
Struktur sedia ada
PDB	Pencarian ortolog: PDBe RCSB
Senarai kod PDB
	1BH7, 1BNX, 1BTQ, 1BTR, 1BTS, 1BTT, 1BZK, 1HYN, 3BTB, 2BTA, 2BTB, 4KY9, 4YZF
Pengecam
Alias	SLC4A1, solute carrier family 4 (anion exchanger), member 1 (Diego blood group), AE1, BND3, CD233, DI, EMPB3, EPB3, FR, RTA1A, SW, WD, WD1, WR, CHC, SAO, SPH4, solute carrier family 4 member 1 (Diego blood group)
Pengecam-pengecam luaran	OMIM: 109270 MGI: 109393 HomoloGene: 133556 GeneCards: SLC4A1
Kedudukan gen (Manusia)
Kr.	Kromosom 17
Tamat	44,268,141 bp
Corak ekspresi RNA
	Top expressed in
	trabecular bone; ; Sumsum tulang; ; bone marrow cells; ; renal medulla; ; darah; ; monocyte; ; kidney tubule; ; Vena kava; ; glomerulus; ; human kidney;
	Top expressed in
	fetal liver hematopoietic progenitor cell; ; darah; ; tibiofemoral joint; ; janin; ; internal carotid artery; ; body of femur; ; external carotid artery; ; Kantung yolka; ; endocardial cushion; ; limpa;
	More reference expression data
	Rujukan lanjutan untuk data ekspresi
Ontologi gen
Fungsi molekul	protein homodimerization activity; protein-membrane adaptor activity; chloride transmembrane transporter activity; transporter activity; anion transmembrane transporter activity; bicarbonate transmembrane transporter activity; Pengikatan protein plasma; ankyrin binding; inorganic anion exchanger activity; sodium:bicarbonate symporter activity; hemoglobin binding;
Komponen sel	integral component of membrane; blood microparticle; membran; cortical cytoskeleton; Membran plasma; integral component of plasma membrane; basolateral plasma membrane; extracellular exosome; Z discdkac; cytoplasmic side of plasma membrane;
Proses biologi	anion transport; bicarbonate transport; cellular ion homeostasis; chloride transport; ion transport; regulation of intracellular pH; anion transmembrane transport; chloride transmembrane transport; sodium ion transmembrane transport; transport; Glikolisis; Penggumpalan; plasma membrane phospholipid scrambling; negative regulation of urine volume; pH elevation; erythrocyte development; protein localization to plasma membrane;
	Sumber:Amigo / QuickGO
Ortolog
	6521
	20533
	ENSG00000004939
	ENSMUSG00000006574
	P02730
	P04919
	NM_000342
	NM_011403
	NP_000333
	NP_035533
	Wikidata
Papar/Sunting data manusia	Papar/Sunting data mencit

Protein pengangkut anion jalur 3, juga dikenali sebagai penukar anion 1 (AE1) atau jalur 3 atau keluarga pembawa zat terlarut 4, ahli 1 (SLC4A1), ialah protein yang dikodkan oleh gen SLC4A1 dalam manusia.

Protein pengangkutan anion jalur 3 ialah protein pengangkutan yang dipelihara secara filogenetik yang bertanggungjawab untuk mengantarkan pertukaran klorida (Cl^-) dengan bikarbonat (HCO₃^-) merentasi membran plasma. Ahli klad AE yang serupa secara fungsian ialah AE2 dan AE3.^[4]

Fungsi

Jalur 3 terdapat di muka basolateral sel berselangan α pada duktus pengumpul nefron, sel-sel perembesan asid utama buah pinggang. Ia menjana ion hidrogen dan ion bikarbonat daripada karbon dioksida dan air–tindak balas yang dimangkinkan oleh karbonik anhidrase. Ion hidrogen dipam ke dalam tubul saluran pengumpul oleh H⁺ ATPase vakuol, sejenis pam proton apikal, dan dengan itu, mengeluarkan asid ke dalam air kencing. kAE1 menukar bikarbonat dengan klorida di permukaan basolateral, pada asasnya mengembalikan bikarbonat ke dalam darah. Di sini, ia melaksanakan dua fungsi:^{[perlu rujukan]}

Pertukaran klorida elektroneutral dan bikarbonat merentasi membran plasma secara satu-untuk-satu. Ini adalah penting bagi pengambilan CO₂ oleh sel darah merah dan penukaran (oleh penghidratan yang dimangkin oleh karbonik anhidrase) kepada proton dan ion bikarbonat. Bikarbonat kemudiannya dikumuhkan (sebagai pertukaran untuk klorida) dari sel dengan jalur 3.
Hubungan fizikal membran plasma ke rangka membran yang mendasari (melalui pengikatan dengan ankirin dan protein 4.2). Ini nampaknya untuk mengelakkan kehilangan permukaan membran, dan bukannya berkaitan dengan pemasangan rangka membran.

Taburan

Ia ada di mana-mana di seluruh vertebrat. Dalam mamalia, ia terdapat dalam dua tapak khusus:^{[perlu rujukan]}

membran sel eritrosit (sel darah merah) dan
permukaan basolateral sel berinterkalasi alfa (jenis sel merembes asid) dalam duktus pengumpul buah pinggang.

Produk gen

Bentuk eritrosit dan buah pinggang adalah isobentuk berbeza bagi protein yang sama.^[5]

Isoform eritrosit AE1, dikenali sebagai eAE1, terdiri daripada 911 asid amino. eAE1 ialah komponen struktur penting membran sel eritrosit yang merangkumi 25% daripada permukaan membran sel. Setiap sel merah mengandungi kira-kira satu juta salinan eAE1.^{[perlu rujukan]}

Isoform buah pinggang AE1, dikenali sebagai kAE1 (iaitu 65 asid amino lebih pendek daripada erythroid AE1) ditemui dalam membran basolateral sel berinterkalasi alfa dalam duktus pengumpul korteks buah pinggang.

Kepentingan klinikal

Mutasi AE1 buah pinggang menyebabkan asidosis tiub renal distal (jenis 1), iaitu ketidakupayaan untuk mengasidkan air kencing walaupun darah terlalu berasid. Mutasi ini menyebabkan penyakit kerana ia menyebabkan salah sasaran protein jalur 3 termutasi supaya ia kekal dalam sel atau kadang-kadang dialamatkan ke permukaan yang salah (iaitu apikal).^{[perlu rujukan]}

Mutasi eritrosit AE1 yang menjejaskan domain ekstrasel molekul boleh menyebabkan perubahan dalam kumpulan darah individu, kerana jalur 3 menentukan sistem antigen Diego (kumpulan darah).^{[perlu rujukan]}

Lebih penting lagi, mutasi eritrosit AE1 menyebabkan 15-25% kes sferositosis keturunan (gangguan berkaitan dengan kehilangan membran sel merah progresif), dan juga menyebabkan keadaan keturunan stomatositosis keturunan^[6] dan ovalositosis Asia Tenggara.^[7]

Interaksi

Jalur 3 telah ditunjukkan berinteraksi dengan CA2^[8]^[9]^[10]^[11] dan CA4.^[12]

Penemuan

AE1 ditemui berikutan SDS-PAGE (elektroforesis gel natrium dodesil sulfat poliakrilamida) daripada membran sel eritrosit. Jalur "ketiga" besar pada gel elektroforesis mewakili AE1, dan pada mulanya dipanggil "jalur 3".^[13]

Rujukan

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000004939 - Ensembl, May 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Molecular physiology and genetics of Na+-independent SLC4 anion exchangers". Journal of Experimental Biology. 212 (11): 1672–1683. 2009. doi:10.1242/jeb.029454. PMC 2683012. PMID 19448077.
^ "Co-clustering of denatured hemoglobin with band 3: its role in binding of autoantibodies against band 3 to abnormal and aged erythrocytes". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83 (16): 6137–41. August 1986. Bibcode:1986PNAS...83.6137S. doi:10.1073/pnas.83.16.6137. PMC 386454. PMID 3461480.
^ "Monovalent cation leaks in human red cells caused by single amino-acid substitutions in the transport domain of the band 3 chloride-bicarbonate exchanger, AE1". Nat. Genet. 37 (11): 1258–63. 2005. doi:10.1038/ng1656. PMID 16227998.
^ "Deletion in erythrocyte band 3 gene in malaria-resistant Southeast Asian ovalocytosis". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88 (24): 11022–6. 1991. Bibcode:1991PNAS...8811022J. doi:10.1073/pnas.88.24.11022. PMC 53065. PMID 1722314.
^ "A transport metabolon. Functional interaction of carbonic anhydrase II and chloride/bicarbonate exchangers". J. Biol. Chem. 276 (51): 47886–94. Dec 2001. doi:10.1074/jbc.M105959200. PMID 11606574.
^ "Carbonic anhydrase II binds to the carboxyl terminus of human band 3, the erythrocyte C1-/HCO3- exchanger". J. Biol. Chem. 273 (43): 28430–7. October 1998. doi:10.1074/jbc.273.43.28430. PMID 9774471.
^ "Localization of the Cl-/HCO3- anion exchanger binding site to the amino-terminal region of carbonic anhydrase II". Biochemistry. 39 (44): 13344–9. November 2000. doi:10.1021/bi0015111. PMID 11063570.
^ "Identification of the carbonic anhydrase II binding site in the Cl(-)/HCO(3)(-) anion exchanger AE1". Biochemistry. 39 (18): 5527–33. May 2000. doi:10.1021/bi992564p. PMID 10820026.
^ "The extracellular component of a transport metabolon. Extracellular loop 4 of the human AE1 Cl-/HCO3- exchanger binds carbonic anhydrase IV". J. Biol. Chem. 277 (28): 25239–46. July 2002. doi:10.1074/jbc.M202562200. PMID 11994299.
^ Alberts, Bruce; Johnson, Alexander; Lewis, Julian; Raff, Martin; Roberts, Keith; Walter, Peter. Molecular Biology of the Cell (ed. Fourth). Garland Science. m/s. 604. ISBN 0815332181.

Pautan luar

Sistem kumpulan darah Diego di Pangkalan Data Mutasi Gen Antigen Kumpulan Darah BGMUT di NCBI, NIH
Band+3+Protein dalam Tajuk Subjek Perubatan (MeSH) di Perpustakaan Perubatan Negara AS
Chloride-Bicarbonate+Antiporters dalam Tajuk Subjek Perubatan (MeSH) di Perpustakaan Perubatan Negara AS
Kedudukan genom SLC4A1 manusia dan butiran gen SLC4A1 di UCSC Genome Browser.

Templat:Kluster pembezaan

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000004939 - Ensembl, May 2017

[2] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[3] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Molecular physiology and genetics of Na+-independent SLC4 anion exchangers". Journal of Experimental Biology. 212 (11): 1672–1683. 2009. doi:10.1242/jeb.029454. PMC 2683012. PMID 19448077.

[pmid3461480-5] "Co-clustering of denatured hemoglobin with band 3: its role in binding of autoantibodies against band 3 to abnormal and aged erythrocytes". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83 (16): 6137–41. August 1986. Bibcode:1986PNAS...83.6137S. doi:10.1073/pnas.83.16.6137. PMC 386454. PMID 3461480.

[pmid16227998-6] "Monovalent cation leaks in human red cells caused by single amino-acid substitutions in the transport domain of the band 3 chloride-bicarbonate exchanger, AE1". Nat. Genet. 37 (11): 1258–63. 2005. doi:10.1038/ng1656. PMID 16227998.

[pmid1722314-7] "Deletion in erythrocyte band 3 gene in malaria-resistant Southeast Asian ovalocytosis". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88 (24): 11022–6. 1991. Bibcode:1991PNAS...8811022J. doi:10.1073/pnas.88.24.11022. PMC 53065. PMID 1722314.

[pmid11606574-8] "A transport metabolon. Functional interaction of carbonic anhydrase II and chloride/bicarbonate exchangers". J. Biol. Chem. 276 (51): 47886–94. Dec 2001. doi:10.1074/jbc.M105959200. PMID 11606574.

[pmid9774471-9] "Carbonic anhydrase II binds to the carboxyl terminus of human band 3, the erythrocyte C1-/HCO3- exchanger". J. Biol. Chem. 273 (43): 28430–7. October 1998. doi:10.1074/jbc.273.43.28430. PMID 9774471.

[pmid11063570-10] "Localization of the Cl-/HCO3- anion exchanger binding site to the amino-terminal region of carbonic anhydrase II". Biochemistry. 39 (44): 13344–9. November 2000. doi:10.1021/bi0015111. PMID 11063570.

[pmid10820026-11] "Identification of the carbonic anhydrase II binding site in the Cl(-)/HCO(3)(-) anion exchanger AE1". Biochemistry. 39 (18): 5527–33. May 2000. doi:10.1021/bi992564p. PMID 10820026.

[pmid11994299-12] "The extracellular component of a transport metabolon. Extracellular loop 4 of the human AE1 Cl-/HCO3- exchanger binds carbonic anhydrase IV". J. Biol. Chem. 277 (28): 25239–46. July 2002. doi:10.1074/jbc.M202562200. PMID 11994299.

[13] Alberts, Bruce; Johnson, Alexander; Lewis, Julian; Raff, Martin; Roberts, Keith; Walter, Peter. Molecular Biology of the Cell (ed. Fourth). Garland Science. m/s. 604. ISBN 0815332181.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]