Kimotripsin
Kimotripsin (EC 3.4.21.1, kimotripsin A dan B, avazim, alfa-kimotripsin) ialah sebuah komponen enzim pencernaan dalam jus pankreas yang bertindak dalam duodenum, di mana ia melaksanakan proteolisis, yakni penguraian protein dan polipeptida.[2] Kimotripsin bercenderung memutuskan ikatan amida peptida, di mana rantai sisi terminal N terhadap ikatan amida yang dipotong (kedudukan P1) ialah asid amino hidrofobik (tirosina, triptofan dan fenilalanina).[3] Asid amino ini mengandungi gelang aromatik dalam rantai sisinya yang muat ke dalam poket hidrofobik (kedudukan S1) enzim. Ia diaktifkan dengan kehadiran tripsin. Pelengkapan kehidrofobikan dan bentuk antara peptida substrat P1 rantai sisi dengan rongga pengikat enzim S1 menyumbang kepada kekhususan substrat enzim ini.[4][5] Kimotripsin juga menghidrolisiskan ikatan amida lain dalam kadar yang lebih rendah, terutamanya ikatan dengan leusina di kedudukan P1.[6]
Kimotripsin | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Pengenal pasti | |||||||||
Nombor EC | 3.4.21.1 | ||||||||
Nombor CAS | 9004-07-3 | ||||||||
Pangkalan data | |||||||||
IntEnz | Lihat IntEnz | ||||||||
BRENDA | Entri BRENDA | ||||||||
ExPASy | Lihat NiceZyme | ||||||||
KEGG | Entri KEGG | ||||||||
MetaCyc | Laluan metabolik | ||||||||
PRIAM | Profil | ||||||||
Struktur PDB | RCSB PDB PDBj PDBe PDBsum | ||||||||
Ontologi gen | AmiGO / EGO | ||||||||
|
Kimotripsin | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Pengenal pasti | |||||||||
Nombor EC | 3.4.21.2 | ||||||||
Nombor CAS | 9036-09-3 | ||||||||
Pangkalan data | |||||||||
IntEnz | Lihat IntEnz | ||||||||
BRENDA | Entri BRENDA | ||||||||
ExPASy | Lihat NiceZyme | ||||||||
KEGG | Entri KEGG | ||||||||
MetaCyc | Laluan metabolik | ||||||||
PRIAM | Profil | ||||||||
Struktur PDB | RCSB PDB PDBj PDBe PDBsum | ||||||||
|
Pengaktifan
suntingKimotripsin disintesis di dalam pankreas. Bentuk enzim asalnya ialah kimotripsinogen. Tripsin mengaktifkan kimotripsinogen dengan membelah ikatan peptida dalam kedudukan Arg15–Ile16, menghasilkan π-kimotripsin. Seterusnya, kumpulan amina (-NH3+) sisa Ile16 berinteraksi dengan rantai sisi Asp194, menghasilkan "lubang oksianion" dan "poket S1" hidrofobik. Selain itu, kimotripsin mendorong pengaktifannya sendiri dengan membelah di kedudukan 14-15, 146-147, dan 148-149, menghasilkan α-kimotripsin yang lebih aktif dan stabil daripada π-kimotripsin.[7] Molekul yang terhasil ialah molekul tiga polipeptida yang terikat dengan ikatan disulfida.
Kegunaan
suntingKimotripsin pernah digunakan dalam tetapan pembedahan katarak.[8] Ia dipasarkan dengan jenama Zolyse.[9]
Isozim
sunting
|
|
|
Lihat juga
suntingRujukan
sunting- ^ PDB: 1CHG; Freer ST, Kraut J, Robertus JD, Wright HT, Xuong NH (April 1970). "Chymotrypsinogen: 2.5-angstrom crystal structure, comparison with alpha-chymotrypsin, and implications for zymogen activation". Biochemistry. 9 (9): 1997–2009. doi:10.1021/bi00811a022. PMID 5442169.
- ^ Wilcox PE (1970). "[5] Chymotrypsinogens—chymotrypsins". Chymotrypsinogens — chymotrypsins. Methods in Enzymology. 19. m/s. 64–108. doi:10.1016/0076-6879(70)19007-0. ISBN 978-0-12-181881-4.
- ^ Cotten, Steven W. (2020-01-01), Clarke, William; Marzinke, Mark A. (penyunting), "Chapter 33 - Evaluation of exocrine pancreatic function", Contemporary Practice in Clinical Chemistry (Fourth Edition) (dalam bahasa Inggeris), Academic Press, m/s. 573–585, ISBN 978-0-12-815499-1, dicapai pada 2023-03-18
- ^ Appel W (December 1986). "Chymotrypsin: molecular and catalytic properties". Clin. Biochem. 19 (6): 317–22. doi:10.1016/S0009-9120(86)80002-9. PMID 3555886.
- ^ Berger A, Schechter I (February 1970). "Mapping the active site of papain with the aid of peptide substrates and inhibitors". Philos. Trans. R. Soc. Lond. B Biol. Sci. 257 (813): 249–64. Bibcode:1970RSPTB.257..249B. doi:10.1098/rstb.1970.0024. PMID 4399049. S2CID 6877875.
- ^ Cotten, Steven W. (2020-01-01), Clarke, William; Marzinke, Mark A. (penyunting), "Chapter 33 - Evaluation of exocrine pancreatic function", Contemporary Practice in Clinical Chemistry (Fourth Edition) (dalam bahasa Inggeris), Academic Press, m/s. 573–585, ISBN 978-0-12-815499-1, dicapai pada 2023-03-18
- ^ Phillips, Jo (2019). Fundamentals of Enzymology. EDTECH. m/s. 117. ISBN 9781839471605.
- ^ REED H (April 1960). "Chymotrypsin in cataract surgery". Canadian Medical Association Journal. 82 (15): 767–70. PMC 1938008. PMID 14436866.
- ^ https://www.fda.gov/media/136420/download Templat:Bare URL inline
Pautan luar
sunting- Pangkalan data dalam talian MEROPS bagi peptidase dan perencat: S01.001 Diarkibkan 2019-09-15 di Wayback Machine
- Chymotrypsin dalam Tajuk Subjek Perubatan (MeSH) di Perpustakaan Perubatan Negara AS